云南地质工程第二勘察院为原云南省地矿局第二水文地质工程地质大队。是由原基建工程兵水文部队“九一一”团、云南省地矿局地热地质队和第二水文工程地质队三家于1984年合并组建而成，并于1993年更名为“云南地质工程第二勘察院”，2008年云南省地矿测绘院整体并入云南地质工程第二勘察院。

   云南地质工程第二勘察院是云南省勘察设计单位50强之一，主要从事地质灾害评估、勘查、设计与施工、岩土工程勘察与设计，水文地质勘查、环境地质勘察、矿产勘查及钻探、水土保持方案编制、工程物探勘探、岩土工程测试、工程测量、地理信息系统、土地规划及开发整理等业务。

   持有工程勘察甲级资质、地基基础一级施工资质；地质灾害勘查甲级、设计甲级、施工甲级、地质灾害危险性评估甲级资质；地热水资源开采施工、评价甲级资质；固体矿产勘查乙级证书；工程测绘甲级资质；水土保持方案编制乙级及云南省地籍数字化建库资格；省级计量认证合格单位证书，并已于2004年通过了iso9001国际质量体系认证。