甘肃水文地质工程地质勘察院成立于1986年。先后在甘肃省地矿局第二勘查院2000年和2002年的两次重组中，与原甘肃省地矿局物探队、甘肃省地矿局化探队、甘肃省地矿局第五勘查院等单位合并组建为新的甘肃省地质矿产勘查开发局第二地质矿产勘查院，保留甘肃水文地质工程地质勘察院。
甘肃水文地质工程地质勘察院是国家建设部批准的综合类甲级勘察单位，专业从事水文地质、工程地质勘察，水文水资源论证、评价、测量；岩土工程勘察、设计、监测、检测、施工；地质灾害评估、勘察、设计、治理施工；矿山尾矿稳定性评价；工程测量、工程物探、工程咨询及计算机应用等业务。现有职工225人，其中高级工程师35人，工程师20人，助理工程师39人，技术员101人。拥有国家注册岩土工程师8人，注册咨询师5人，注册一级建造师2人，注册二级建造师8人，注册造价师1人。
资质业绩：
甘肃水文地质工程地质勘察院是甘肃省勘察设计协会、甘肃省土木建筑学会、全国工程咨询协会、甘肃省工程咨询协会会员单位。现持有建设部颁发的工程勘察综合类甲级证书（证书号270008-kj）；国土资源部颁发的地质灾害防治工程勘察、评估、设计、施工甲级资格证书；拥有国家发改委颁发的乙级工程咨询证书；甘肃省水利厅颁发的水文水资源调查评价乙级资质证书。
近年来，我院在省内外工程勘察、工程咨询、灾害勘察、设计、评估及治理施工等业务上取得了骄人的业绩。先后荣获建设部级优秀勘察奖2项，甘肃省建设厅优秀勘察(设计)奖4项，甘肃省咨询协会优秀工程咨询成果奖4项，省级地质灾害防治成果奖3项，甘肃省地矿局工勘项目优秀成果奖5项，全国优秀质量管理小组1项，全省优秀、先进QC质量管理小组13项。2007年荣获全国勘察设计协会授予的“全国勘察行业诚信单位”称号，2008年获甘肃省勘察设计协会授予的“优秀勘察设计企业”称号，是甘肃省“守合同、重信用”单位。
作为专业队伍，甘肃水文地质工程地质勘察院在稳步推进自身持续发展的同时，积极融入地方经济建设，认真履行为经济社会发展提供技术支持的职责和义务。汶川地震，两次派出专家组赴陇南灾区开展地质灾害隐患排查工作，被国土资源部授予“抗震救灾地质灾害应急排查先进集体”称号；玉树地震，派出应急调查队赴灾区开展地质灾害排查工作；舟曲山洪泥石流灾害，第一时间派出应急排查队伍赴灾区开展工作，受到了国土资源部的通报表扬。
“诚信守约，科学管理，持续改进，满足顾客”是我院的质量方针。面对广阔的市场空间，我院将严格推行“ISO9001质量管理体系”，继续以一流的服务、过硬的技术、优良的装备、良好的信誉服务于社会，为甘肃经济的发展和国家建设做出新的贡献。