队伍始建于1958年，前身是贵州省地质局109地质大队、物探队、物化探大队。主要承担贵州省1：20万区域策略调查、1：20万区域化探扫面工作和物探深部、化探浅部地质找水找矿工作，为贵州的地质找矿特别是金矿的发现和勘查开发作出了重大贡献。

        五十多年来完成了50余项地质科研成果，多项成果获得国家、省、部有关部门的奖励。《金矿地质科研成果报告》获得国务院黄金工作领导小组、地矿部嘉奖，《黔西南微细粒金矿成矿条件及选冶研究》获得地矿部“科技成果奖”《南盘江地区浅层地壳强击机与金矿分布模式研究》获得贵州省科学进步二等奖。

        2013年5月，局党委按照实现找矿突破、加快矿业开发、拓展服务领域、构建和谐地矿的科学发展目标要求，决定在物化勘院的基础上，在黔西南州组建贵州省地矿局109地质大队，将物化勘院的工作重心转移到黔西南州，更好地实现地质工作服务黔西南州经济社会发展，物化勘院与109队实行“一套班子、两块牌子”经营管理体制。在局党委和黔西南贵州省地矿局地球物理地球化学勘查院是一支从事固体矿产勘查、地球物理勘查、地球化学勘查、水文地质勘查、工程地质勘查、环境地质勘查、地质测绘、地质灾害防治业务为主的综合性勘查队伍。在局党委和黔西南州委州政府的关心支持下，经过4个多月的努力，109队于9月24日正式挂牌成立。